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CPHI制藥在線 資訊 Nature子刊:馮建峰/程煒團(tuán)隊(duì)開發(fā)機(jī)器學(xué)習(xí)模型,識別自殺行為風(fēng)險(xiǎn)因素

Nature子刊:馮建峰/程煒團(tuán)隊(duì)開發(fā)機(jī)器學(xué)習(xí)模型,識別自殺行為風(fēng)險(xiǎn)因素

來源:生物世界
  2024-07-04
自殺行為已經(jīng)成為全球范圍內(nèi)一個(gè)嚴(yán)峻的公共衛(wèi)生問題,給社會帶來了巨大壓力和挑戰(zhàn)。據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計(jì),每年約有70萬人因自殺而死亡,平均每45秒就有一人自殺。這不僅給逝者的家屬和朋友帶來了深深的悲痛,還對社會的經(jīng)濟(jì)和醫(yī)療資源造成了沉重負(fù)擔(dān)。

       自殺行為已經(jīng)成為全球范圍內(nèi)一個(gè)嚴(yán)峻的公共衛(wèi)生問題,給社會帶來了巨大壓力和挑戰(zhàn)。據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計(jì),每年約有70萬人因自殺而死亡,平均每45秒就有一人自殺。這不僅給逝者的家屬和朋友帶來了深深的悲痛,還對社會的經(jīng)濟(jì)和醫(yī)療資源造成了沉重負(fù)擔(dān)。

       自殺行為背后的風(fēng)險(xiǎn)因素復(fù)雜多樣,包括心理健康問題、社會經(jīng)濟(jì)壓力、文化因素等,因此,深入研究和識別這些風(fēng)險(xiǎn)因素,對于預(yù)防和干預(yù)自殺行為至關(guān)重要。通過了解自殺行為的風(fēng)險(xiǎn)因素譜,我們可以更有針對性地制定預(yù)防策略,提升社會整體的心理健康水平,挽救更多的生命。

       2024年7月2日,復(fù)旦大學(xué)類腦智能科學(xué)與技術(shù)研究院馮建峰教授/程煒研究員團(tuán)隊(duì)(博士后張蓓為第一作者)在 Nature 子刊 Nature Human Behaviour 上發(fā)表了題為:Identifying behaviour-related and physiological risk factors for suicide attempts in the UK Biobank 的研究論文。
       該研究基于英國生物樣本庫(UK Biobank)30多萬人的行為學(xué)、神經(jīng)影像組學(xué)、血液和代謝組學(xué)及蛋白組學(xué)數(shù)據(jù),通過多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析,全面評估與自殺行為關(guān)聯(lián)的多維度風(fēng)險(xiǎn)因素,最終識別出與自殺行為及其遺傳易感性顯著關(guān)聯(lián)的246個(gè)行為學(xué)風(fēng)險(xiǎn)因素和200個(gè)生物學(xué)風(fēng)險(xiǎn)因素,如社會經(jīng)濟(jì)環(huán)境、生活方式、身心健康、童年經(jīng)歷和腦灰質(zhì)體積等。在此基礎(chǔ)上,研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種基于行為學(xué)特征的機(jī)器學(xué)習(xí)判別模型,在區(qū)分有無自殺行為上表現(xiàn)出高判別力(AUC=0.909)。該研究對自殺行為的多維度風(fēng)險(xiǎn)因素識別提供了全面的見解,有助于自殺行為的早期預(yù)警和個(gè)性化干預(yù)。
Identifying behaviour-related and physiological risk factors for suicide attempts in the UK Biobank 的研究論文
       研究團(tuán)隊(duì)基于UK Biobank數(shù)據(jù),首先估算了334706名參與者的自殺行為的多基因風(fēng)險(xiǎn)評分(polygenic risk scores,PRS),對涵蓋12個(gè)不同類別的行為學(xué)和生物學(xué)因素(2291個(gè))進(jìn)行全表型關(guān)聯(lián)分析(phenome-wide association study,PheWAS),最終識別了與自殺行為遺傳易感性顯著關(guān)聯(lián)的246個(gè)行為學(xué)風(fēng)險(xiǎn)因素(63.07%)和200個(gè)生物學(xué)風(fēng)險(xiǎn)因素(10.41%)。
圖1:研究的總體思路

圖1:研究的總體思路

       其中,與自殺行為PRS顯著關(guān)聯(lián)的行為學(xué)風(fēng)險(xiǎn)因素(圖2A)主要包括生活方式、心理健康、社會經(jīng)濟(jì)環(huán)境、軀體健康等類別。較高的自殺行為PRS與較低的社會經(jīng)濟(jì)環(huán)境等因素有關(guān),比如家庭收入、居住質(zhì)量、工作方式以及教育水平等。此外,較高的自殺行為PRS也和不良的生活方式有關(guān),比如睡眠問題、吸煙飲酒行為、飲食習(xí)慣、電子設(shè)備使用行為等。此外,較高的自殺行為PRS也和身心健康狀態(tài)有關(guān),比如較高的自殺行為PRS和軀體疾?。ㄈ缈傮w健康狀況、癌癥、糖尿病)以及心理狀態(tài)(抑郁癥狀、創(chuàng)傷事件、神經(jīng)質(zhì)評分)等因素有關(guān)。
圖2:PheWAS分析中與自殺行為PRS關(guān)聯(lián)的行為學(xué)表型(圖A)和病例-對照分析中與自殺行為關(guān)聯(lián)的行為學(xué)表型(圖B)

圖2:PheWAS分析中與自殺行為PRS關(guān)聯(lián)的行為學(xué)表型(圖A)和病例-對照分析中與自殺行為關(guān)聯(lián)的行為學(xué)表型(圖B)

       對于顯著識別的200個(gè)生物學(xué)風(fēng)險(xiǎn)因素,涵蓋20個(gè)神經(jīng)影像學(xué)表型(包括13個(gè)腦區(qū)的灰質(zhì)體積和7個(gè)腦區(qū)的白質(zhì)微結(jié)構(gòu))、76種血液和代謝生物標(biāo)志物和104種蛋白標(biāo)志物。具體而言,在影像學(xué)表型上,較高的自殺行為PRS和較低的灰質(zhì)體積相關(guān),包括右側(cè)島葉、杏仁核、腹內(nèi)側(cè)前額葉皮層、內(nèi)側(cè)和外側(cè)眶額皮層、緣上回、左側(cè)顳上回、雙側(cè)中扣帶回等(圖3A)。此外,較高的自殺行為PRS與白質(zhì)微結(jié)構(gòu)的各向異性(Fractional Anisotropy)降低(涉及胼胝體輻射線額部纖維束、內(nèi)側(cè)丘系纖維束和上后部丘腦輻射纖維束)顯著相關(guān)(圖3B)。
圖3:PheWAS分析中與自殺行為PRS顯著關(guān)聯(lián)的神經(jīng)影像學(xué)標(biāo)志物

圖3:PheWAS分析中與自殺行為PRS顯著關(guān)聯(lián)的神經(jīng)影像學(xué)標(biāo)志物

       在血液和代謝表型上,較高的自殺行為PRS與較高的白細(xì)胞指數(shù)(如白細(xì)胞和淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù))和紅細(xì)胞指數(shù)相關(guān)(圖4A)。在血液生化方面,較高的C 反應(yīng)蛋白、甘油三酯和γ-谷氨酰基轉(zhuǎn)移酶以及較低的 IGF-1、維生素 D 和高密度脂蛋白膽固醇與較高的自殺PRS 呈顯著相關(guān)(圖4A)。此外,研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn)104 個(gè)蛋白與自殺PRS呈顯著相關(guān)(圖4B)。相對于其他類別蛋白,炎癥蛋白與自殺PRS的關(guān)聯(lián)更為明顯,其中 BTN3A2 和 CXCL17 的關(guān)聯(lián)最為顯著。
圖4:PheWAS分析中與自殺行為PRS顯著關(guān)聯(lián)的血液和代謝標(biāo)志物以及蛋白標(biāo)志物

圖4:PheWAS分析中與自殺行為PRS顯著關(guān)聯(lián)的血液和代謝標(biāo)志物以及蛋白標(biāo)志物

       其次,為了驗(yàn)證這些風(fēng)險(xiǎn)因素,研究團(tuán)隊(duì)對3,558名自殺未遂個(gè)體和149,976名對照個(gè)體的所有表型進(jìn)行邏輯回歸分析,發(fā)現(xiàn)83%與自殺行為PRS關(guān)聯(lián)的行為風(fēng)險(xiǎn)因素得到驗(yàn)證(圖2B)。
       隨后,研究團(tuán)隊(duì)利用孟德爾隨機(jī)分析探究以上關(guān)聯(lián)的表型與自殺行為之間潛在的因果關(guān)系。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)57個(gè)行為學(xué)因素(主要包括神經(jīng)質(zhì)、抑郁程度、首次性行為年齡、抽煙、家庭收入情況、身體健康狀況等)和1個(gè)生物學(xué)因素(即白細(xì)胞計(jì)數(shù))是導(dǎo)致自殺行為形成的潛在因果因素(圖5)。針對導(dǎo)致自殺行為形成的行為學(xué)風(fēng)險(xiǎn)因素,研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步利用中介分析探究了這些行為學(xué)因素潛在的生物學(xué)基礎(chǔ)。
圖5:風(fēng)險(xiǎn)因素與自殺行為之間潛在的因果關(guān)系(部分)

圖5:風(fēng)險(xiǎn)因素與自殺行為之間潛在的因果關(guān)系(部分)

       最后,研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種基于行為學(xué)、代謝組學(xué)和蛋白組學(xué)的機(jī)器學(xué)習(xí)判別模型(圖6),用以區(qū)分是個(gè)體是否發(fā)生自殺行為。研究發(fā)現(xiàn)基于16種行為學(xué)特征的分類模型在區(qū)分有無自殺行為上表現(xiàn)出高判別準(zhǔn)確性(AUC=0.909)。其中,最重要的預(yù)測因素包含:是否遭受精神痛苦、是否感到毫無價(jià)值、首次抑郁發(fā)作時(shí)的年齡、是否因焦慮或抑郁看精神病醫(yī)生、以及是否在抑郁期間產(chǎn)生死亡想法。這個(gè)結(jié)果強(qiáng)調(diào),患有精神痛苦是識別有無自殺行為史個(gè)體的最關(guān)鍵預(yù)測因子。這一結(jié)果與Shneidman在1993年提出的假設(shè)相一致,即心理痛苦是導(dǎo)致自殺行為的一個(gè)重要誘發(fā)因素。
圖6:基于行為學(xué)特征的機(jī)器學(xué)習(xí)分類模型預(yù)測因子的重要度排序和預(yù)測準(zhǔn)確度

圖6:基于行為學(xué)特征的機(jī)器學(xué)習(xí)分類模型預(yù)測因子的重要度排序和預(yù)測準(zhǔn)確度

       論文共同通訊作者,復(fù)旦大學(xué)類腦智能科學(xué)與技術(shù)研究院馮建峰教授表示,這項(xiàng)研究開發(fā)了一個(gè)基于行為學(xué)特征的機(jī)器學(xué)習(xí)模型。排名前16位的預(yù)測因子在區(qū)分有無自殺行為的個(gè)體方面表現(xiàn)出很高的辨別準(zhǔn)確性。這可能有助于識別未來識別自殺高危人群。除了精神痛苦以及抑郁癥相關(guān)的預(yù)測因子外,主要的行為學(xué)預(yù)測因子是個(gè)體的童年經(jīng)歷和性侵犯受害者。這些因素為臨床醫(yī)生制定更好的預(yù)防策略提供了潛在的可操作目標(biāo)。
       劍橋大學(xué) Barbara Sahakian 教授評論道:自殺不僅是一種悲慘的生命損失,同時(shí)也會給家人和朋友帶來巨大的打擊。這項(xiàng)研究確定了自殺行為的關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素,讓我們更加了解如何識別易受影響的個(gè)體并進(jìn)行干預(yù)以挽救生命。
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