在一項(xiàng)新的研究中，來(lái)自美國(guó)斯克里普斯研究所等研究機(jī)構(gòu)的研究人員他們研究了在COVID-19大流行的不同階段，不同的強(qiáng)制措施---包括呆在家中、保持社交距離和旅行限制---在防止本地和區(qū)域傳播方面的功效，并指出哪些公共衛(wèi)生措施有效地緩解了COVID-19的傳播，哪些無(wú)效。相關(guān)研究結(jié)果于2023年12月14日在線發(fā)表在Cell期刊上，論文標(biāo)題為“Genomic surveillance reveals dynamic shifts in the connectivity of COVID-19 epidemics”。
這些作者發(fā)現(xiàn)，本地傳播是由地點(diǎn)之間的旅行量驅(qū)動(dòng)的，而不是由地點(diǎn)之間的地理距離驅(qū)動(dòng)的。他們還發(fā)現(xiàn)，部分關(guān)閉美墨邊境并不能有效防止這種病毒的跨境傳播。這些發(fā)現(xiàn)與正在進(jìn)行的基因組監(jiān)測(cè)相結(jié)合，有助于指導(dǎo)公共衛(wèi)生政策，預(yù)防未來(lái)的流行病，緩解 COVID-19 的新“流行”階段。
論文共同通訊作者、斯克里普斯研究所Kristian Andersen實(shí)驗(yàn)室的項(xiàng)目科學(xué)家兼基因組流行病學(xué)家Mark Zeller博士說(shuō)，“我們的研究表明，這并不一定是地理位置有多接近；真正的衡量標(biāo)準(zhǔn)是兩個(gè)地點(diǎn)在人員流動(dòng)方面有多大的聯(lián)系。一般來(lái)說(shuō)，SARS-CoV-2可能是呼吸道病毒傳播的良好模式，了解這些病毒的傳播方式有助于我們?yōu)槲磥?lái)的大流行病制定有針對(duì)性的措施。”
圣地亞哥縣流行病學(xué)和免疫服務(wù)處醫(yī)療主任 Seema Shah 醫(yī)學(xué)博士說(shuō)，“這些寶貴的信息有助于指導(dǎo)減輕未來(lái)病毒威脅傳播的策略，包括我們正在進(jìn)行的基因組監(jiān)測(cè)方法，如廢水檢測(cè)。在全球挑戰(zhàn)需要聯(lián)合應(yīng)對(duì)的時(shí)代，這項(xiàng)新研究也證明了學(xué)術(shù)研究機(jī)構(gòu)與邊境兩側(cè)的公共衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室和醫(yī)院之間的緊密合作。”
為了解釋旅行模式的變化如何影響 COVID-19 在大流行頭兩年的傳播，這些作者定量確定了在不同地點(diǎn)和時(shí)間點(diǎn)收集到的病毒序列之間的遺傳相似性。Zeller說(shuō)，“兩個(gè)不同地點(diǎn)的病毒基因組越相似，這些地點(diǎn)在人員流動(dòng)方面的聯(lián)系就越緊密。”
這些作者對(duì)來(lái)自美國(guó)加州圣地亞哥市和墨西哥下加利福尼亞州的 82000 多份 SARS-CoV-2 樣本進(jìn)行了測(cè)序，并將這些序列與來(lái)自北美和世界其他地區(qū)的 SARS-CoV-2 基因組進(jìn)行了比較。然后，他們將這些基因組數(shù)據(jù)與空中和陸地旅行數(shù)據(jù)（基于匿名手機(jī)追蹤）數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行整合，以估算北美不同縣之間的連通性。
在大流行病的早期階段，針對(duì)COVID-19 的規(guī)定包括嚴(yán)格的居家和社交距離措施，因此傳播主要發(fā)生在本地和區(qū)域?qū)用?--鄰縣內(nèi)部和鄰縣之間。但隨著這些規(guī)定的放寬，人們開(kāi)始更自由地旅行，可以預(yù)見(jiàn)的是，來(lái)自遠(yuǎn)方的傳播增加了。
圖片來(lái)自Cell, 2023, doi:10.1016/j.cell.2023.11.024。
論文第一作者Nathaniel Matteson博士說(shuō)，“在整個(gè)大流行的頭兩年里，鄰縣之間的流動(dòng)性幾乎保持不變，但正是這些從圣地亞哥到更遙遠(yuǎn)的縣或鄰近州的長(zhǎng)途流動(dòng)真正打亂了這些早期的規(guī)定。在規(guī)定放寬后，圣地亞哥流行的病毒中約有 50%是當(dāng)?shù)亓餍械牟《?，還有 50%是最近通過(guò)不同地點(diǎn)之間的旅行傳播進(jìn)來(lái)的。”
他們的分析還顯示，在整個(gè)大流行期間，圣地亞哥和附近的下加利福尼亞州之間一直存在病毒傳播，這表明部分關(guān)閉美墨邊境并不能有效防止病毒傳播。
Matteson說(shuō)，“這一發(fā)現(xiàn)為越來(lái)越多的證據(jù)增添了新的內(nèi)容，這些試圖阻止來(lái)自某一特定地點(diǎn)的人流的有針對(duì)性的措施效果很差，而保持社交距離在減少傳播方面則有效得多。這也凸顯了區(qū)域和國(guó)際合作以及資源共享對(duì)于有效監(jiān)測(cè)和預(yù)防疾病的重要性。”
接下來(lái)，這些作者計(jì)劃以更精細(xì)的尺度研究傳播動(dòng)態(tài)。Zeller說(shuō)，“如今，我們正在研究圣地亞哥縣內(nèi)的超本地傳播---例如，傳播如何受到通勤模式等因素的影響。”
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