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CPHI制藥在線 資訊 蛋白降解劑新篇章:2023年6大創(chuàng)新靶點(diǎn)臨床進(jìn)展深度解析(上)

蛋白降解劑新篇章:2023年6大創(chuàng)新靶點(diǎn)臨床進(jìn)展深度解析(上)

熱門推薦: PROTAC 降解劑 NX-5948
作者:費(fèi)翔  來源:藥智頭條
  2024-01-04
藥物研發(fā)的新趨勢(shì)正在向著精準(zhǔn)醫(yī)療傾斜,即開發(fā)出選擇性更強(qiáng)、針對(duì)性更明確的治療藥物。在這一過程中,眾多企業(yè)紛紛投入巨資生產(chǎn)新藥,但關(guān)鍵在于這些新藥能否提供與現(xiàn)有藥物不同的新機(jī)制,新療效。這種差異化是它們成功與否的決定因素。具體來說,在藥效、表觀遺傳調(diào)控、安全性等關(guān)鍵領(lǐng)域中創(chuàng)造出獨(dú)特的治療方案尤為重要。

       藥物研發(fā)的新趨勢(shì)正在向著精準(zhǔn)醫(yī)療傾斜,即開發(fā)出選擇性更強(qiáng)、針對(duì)性更明確的治療藥物。在這一過程中,眾多企業(yè)紛紛投入巨資生產(chǎn)新藥,但關(guān)鍵在于這些新藥能否提供與現(xiàn)有藥物不同的新機(jī)制,新療效。這種差異化是它們成功與否的決定因素。具體來說,在藥效、表觀遺傳調(diào)控、安全性等關(guān)鍵領(lǐng)域中創(chuàng)造出獨(dú)特的治療方案尤為重要。筆者深信,這三個(gè)領(lǐng)域至關(guān)重要,而且,無論是我們這些致力于藥物開發(fā)的研究人員,還是醫(yī)療領(lǐng)域的臨床專家,我們的終 極使命都是共同探索和創(chuàng)造更好的治療方法,以便為社會(huì)帶來更多的福祉。這是我們的共同追求,也是我們不懈努力的方向。

       PROTAC(蛋白質(zhì)降解靶向嵌合體)就是一種新的治療方法。與傳統(tǒng)的抑制靶蛋白的靶向藥物機(jī)制有所不同,PROTAC通過選擇性降解病因蛋白質(zhì)來發(fā)揮作用,為精準(zhǔn)醫(yī)療開辟了新領(lǐng)域,可能解決當(dāng)前癌癥治療的局限性。

       PROTAC的特點(diǎn)和重要性

       大約85%的蛋白質(zhì)屬于難以靶向的類別,針對(duì)這85%難以靶向的蛋白質(zhì),已經(jīng)出現(xiàn)了多種不同的靶向方法,其中蛋白質(zhì)降解就是一個(gè)新策略。

       去年筆者已經(jīng)對(duì)分子膠和PROTAC的總體概念做了介紹(年度盤點(diǎn):2022年分子膠降解劑波瀾壯闊的一年),今年很多臨床試驗(yàn)有了新進(jìn)展,結(jié)果有喜有淚。本文將結(jié)合各公司公布的臨床研究進(jìn)展,對(duì)PROTAC藥物再次進(jìn)行梳理。

       和傳統(tǒng)靶向致病蛋白的小分子抑制劑不同,利用細(xì)胞內(nèi)垃圾回收系統(tǒng)誘導(dǎo)目標(biāo)蛋白降解是一種新興技術(shù),它可以像掃地機(jī)器人一樣清除人體內(nèi)不需要的蛋白質(zhì)。想象一下,有些蛋白質(zhì)就像壞了的機(jī)器零件,如果不清理掉,可能會(huì)引發(fā)疾病。

       PROTAC和分子膠水(MGD)這兩種“掃地機(jī)器人”通過不同的方式抓住這些壞零件,然后標(biāo)記它們,讓細(xì)胞的清潔系統(tǒng)知道要將它們處理掉。

       PROTAC是一種特別聰明的工具,它可以同時(shí)抓住壞零件和清潔系統(tǒng),把它們拉到一起,確保壞零件被及時(shí)處理。PROTACs或者分子膠可促使目標(biāo)蛋白(POI)與E3泛素連接酶復(fù)合體靠得更近,形成三元復(fù)合物并轉(zhuǎn)移泛素分子。多泛素化標(biāo)記的目標(biāo)蛋白就會(huì)被送至蛋白酶體并隨后降解。PROTAC的結(jié)構(gòu)如圖1所示,其中一端連接我們想要降解的蛋白質(zhì),通過一定長(zhǎng)度的碳鏈連接到可以結(jié)合E3水解酶的化合物上,形成雙節(jié)棍的結(jié)構(gòu)。這種化學(xué)結(jié)構(gòu)能從兩側(cè)吸引蛋白質(zhì),引發(fā)泛素化并促使其降解,這就是PROTAC的工作機(jī)制。

PROTACs與分子膠作用機(jī)理的示意圖

       圖1 PROTACs與分子膠作用機(jī)理的示意圖

       圖片來源:參考論文2

       相比之下,分子膠(Molecular glue)分子量和傳統(tǒng)小分子藥物類似,比如沙利度胺,雖然沒有雙節(jié)棍式的結(jié)構(gòu),但也能直接引發(fā)蛋白質(zhì)間的相互作用。因此,它們以相似的方式引發(fā)泛素化和蛋白質(zhì)降解。從廣義上來看,PROTAC也屬于分子膠,不過分子膠可遇不可求,但是一旦確認(rèn)分子膠結(jié)構(gòu)后成藥性合成難度都是比PROTAC更有優(yōu)勢(shì)。

       降解劑熱門靶點(diǎn)和臨床進(jìn)展

       下圖總結(jié)了適合通過靶向蛋白降解進(jìn)行治療的靶標(biāo)。圖中的圓圈分為六個(gè)部分,每個(gè)部分代表了一個(gè)與PROTAC目標(biāo)相關(guān)的關(guān)鍵領(lǐng)域:耐藥性突變、傳統(tǒng)無法成藥的轉(zhuǎn)錄蛋白、結(jié)構(gòu)蛋白以及基因擴(kuò)增/過表達(dá)等。每個(gè)領(lǐng)域旁邊都列出了相關(guān)降解劑的在研管線,包括Nurix公司的BTK蛋白降解劑、Arvinas公司的Tau蛋白、轉(zhuǎn)錄因子,諾華的TEAD和Arvinas的BCL6、C4公司的BRAF、Prelude公司的SMARCA2降解劑以及Kymera公司的IRAK4蛋白。

圖中的圓圈分為六個(gè)部分,每個(gè)部分代表了一個(gè)與PROTAC目標(biāo)相關(guān)的關(guān)鍵領(lǐng)域:耐藥性突變、傳統(tǒng)無法成藥的轉(zhuǎn)錄蛋白、結(jié)構(gòu)蛋白以及基因擴(kuò)增/過表達(dá)等

       圖2 六大類適合降解劑開發(fā)的靶點(diǎn)蛋白

       圖片來源:根據(jù)參考資料6整理

       AR/ER降解劑

       2013年耶魯大學(xué)的Crews教授創(chuàng)立了第一家專注于PROTAC藥物開發(fā)的Arvinas公司,2018年和19年用于治療前列腺癌的雄性荷爾蒙受體(AR)降解劑ARV-110(bavdegalutamide)和降解雌激素受體(ER)的ARV-471乳腺癌的PROTAC藥物分別進(jìn)入臨床1期。ARV-471正在臨床3期試驗(yàn),預(yù)計(jì)2024年將會(huì)發(fā)布正面結(jié)果。

       另外用于治療耐藥前列腺癌的第二代 AR 雙功能降解劑ARV-766也正在臨床2期試驗(yàn)中。ARV-766與前身ARV-110相比,經(jīng)過優(yōu)化,具有更廣泛的基因型覆蓋范圍和更高的化學(xué)穩(wěn)定性。在最近的一項(xiàng)試驗(yàn)中,42% 的 AR 配體結(jié)合域突變患者根據(jù)前列腺抗原水平獲得了顯著的反應(yīng)。

PROTAC的優(yōu)勢(shì)和挑戰(zhàn)

       圖3 PROTAC的優(yōu)勢(shì)和挑戰(zhàn)

       圖片來源:參考資料2

       BRD降解劑

       除了AR和ER之外,BRDs(溴結(jié)構(gòu)域蛋白)這個(gè)和癌癥相關(guān)的表觀基因?qū)W靶點(diǎn)也在學(xué)術(shù)界和工業(yè)界備受關(guān)注。目前,已有多種BRDs抑制劑進(jìn)入針對(duì)各類癌癥的早期臨床試驗(yàn)。然而,這些抑制劑在臨床中展現(xiàn)的抗腫瘤效果有限,這促使研究者尋找新的治療策略——BRD降解劑。

       臨床前研究表明,抑制和降解BRDs會(huì)導(dǎo)致完全不同的細(xì)胞命運(yùn)和生物學(xué)效應(yīng)。與傳統(tǒng)抑制劑相比,BRDs PROTACs展現(xiàn)出幾個(gè)顯著特點(diǎn),包括更高的選擇性和特異性、克服耐藥性、消除激酶的功能以及快速、可逆地敲低靶點(diǎn)蛋白。例如,BRDs PROTACs(如dBET1/dBET6、ARV-825/ARV-771等)在調(diào)節(jié)基因表達(dá)(如c-MYC)上比傳統(tǒng)BRD抑制劑更有效。這在實(shí)體瘤和血液惡性腫瘤的臨床前模型中導(dǎo)致顯著的細(xì)胞生長(zhǎng)抑制和細(xì)胞凋亡。

       和傳統(tǒng)小分子抑制劑的作用機(jī)理非常不同導(dǎo)致PROTAC在極低濃度下可以相對(duì)持久地發(fā)揮更好的療效。如下圖中的靶向BRD4的PROTAC為例,與傳統(tǒng)BRD4抑制劑相比,BRD4降解劑的DC50濃度低于1nM的比比皆是大部分都接近pM。

與傳統(tǒng)BRD4抑制劑相比,BRD4降解劑的DC50濃度低于1nM的比比皆是大部分都接近pM

       圖4 BRD4降解劑代表結(jié)構(gòu)及活性

       (紅色為結(jié)合BRD4的彈頭,藍(lán)色為結(jié)合E3降解酶的化合物)

       圖片來源:參考論文3

       同屬BRD家族的BRD9也是降解劑藥物的一個(gè)熱門靶點(diǎn)。C4公司通過多輪優(yōu)化將他們公司的口服BRD9降解劑CFT8634推向了1期臨床。如下圖所示,CFT8634將柔性碳鏈優(yōu)化為成藥性更好的剛性連接子,此外還采用了新型的沙利度胺衍生物作為E3泛素連接酶的結(jié)合配體。不過根據(jù)官網(wǎng)公告,C4公司宣布由于臨床數(shù)據(jù)BRD9 降解并沒有對(duì)多發(fā)性骨髓瘤患者產(chǎn)生足夠的療效,這款藥物終止了開發(fā)。(參考資料3)

 BRD9降解劑CFT8634

       圖5 BRD9降解劑CFT8634

       圖片來源:C4官網(wǎng)

       BTK降解劑NX-5948

       首先簡(jiǎn)單地介紹一下為什么要開發(fā)BTK降解劑NX-5948。

       想象一下,我們的身體就像一個(gè)復(fù)雜的城市,在這個(gè)城市里,有一種叫做BTK的蛋白質(zhì),它就像一個(gè)交通指揮官,控制著B細(xì)胞(一種重要的免疫細(xì)胞)的行動(dòng)。但有時(shí)候,這個(gè)指揮官會(huì)出錯(cuò),導(dǎo)致一些疾病,比如某些類型的癌癥和自身免疫性疾病。這時(shí),NX-5948就像是一個(gè)專門的“調(diào)解者”,它能夠找到這個(gè)出錯(cuò)的指揮官(BTK蛋白質(zhì)),并讓它“退休”(也就是降解掉)。這樣,就能幫助治療那些因?yàn)锽TK出錯(cuò)而引起的疾病,比如慢性淋巴細(xì)胞白血病和非霍奇金淋巴瘤。

       除了癌癥,NX-5948還在實(shí)驗(yàn)室里對(duì)付另一個(gè)壞蛋——類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎。在小鼠的實(shí)驗(yàn)中,它顯示出了希望的跡象,能減輕炎癥和關(guān)節(jié)損傷,這意味著它未來可能幫助那些患有類似疾病的人們。

Nurix官網(wǎng)海報(bào)公布的BTK降解劑機(jī)理

       圖6 Nurix官網(wǎng)海報(bào)公布的BTK降解劑機(jī)理

       圖片來源:參考資料7

       NX-5948由Nurix Therapeutics公司開發(fā),是從NX-0492通過對(duì)CRBN binder和Warhead部分不斷優(yōu)化得到的,具有更加穩(wěn)定的構(gòu)型。

從NRX-0492改造得到NX-2127再進(jìn)一步對(duì)E3水解酶結(jié)合小分子的改造獲得了NX-5948

       圖7 從NRX-0492改造得到NX-2127再進(jìn)一步對(duì)E3水解酶結(jié)合小分子的改造獲得了NX-5948

       圖片來源:Nurix公司官網(wǎng)

       NX-5948主要被用于治療多種免疫炎癥性疾病,如類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎。它在臨床前研究中顯示出顯著效果,能夠降低大腦中TMD8腫瘤細(xì)胞和小膠質(zhì)細(xì)胞中的BTK蛋白水平。

NX-5948在細(xì)胞和各種動(dòng)物模型中的活性和藥代學(xué)特性

       圖8 NX-5948在細(xì)胞和各種動(dòng)物模型中的活性和藥代學(xué)特性

       圖片來源:參考資料7

       最近在ASH會(huì)議上,Nurix發(fā)布了關(guān)于NX-5948的1a/1b期臨床試驗(yàn)的數(shù)據(jù)。該試驗(yàn)評(píng)估了NX-5948作為口服藥物在B細(xì)胞惡性腫瘤患者中的劑量效應(yīng)。研究結(jié)果表明,NX-5948具有劑量依賴性藥代動(dòng)力學(xué)特性,能夠在患者中快速、穩(wěn)健地降解BTK蛋白。

 NX-5948臨床結(jié)果

       圖9 NX-5948臨床結(jié)果

       圖片來源:Nurix公司官網(wǎng)

       NX-5948的創(chuàng)新機(jī)制在于其誘導(dǎo)BTK的野生型和突變型降解的能力,有可能克服與傳統(tǒng)BTK抑制劑相關(guān)的耐藥性和不耐受性問題。此外,在膠原誘導(dǎo)性關(guān)節(jié)炎(CIA)小鼠模型中,NX-5948顯示出了有希望的預(yù)臨床活性。CIA是一種廣泛認(rèn)可的類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)模型。在這個(gè)模型中,NX-5948減輕了關(guān)節(jié)炎癥狀,并減少了炎癥和關(guān)節(jié)損傷,表明其在治療自身免疫性疾病方面的潛力。

       除了上文所述靶點(diǎn),下篇筆者將繼續(xù)介紹BRAF降解劑、SMARCA2降解劑,以及結(jié)合了抗體藥物偶聯(lián)物(ADCs)和蛋白質(zhì)降解技術(shù)兩大技術(shù)的創(chuàng)新療法——DAC(降解劑-抗體偶聯(lián)物),歡迎繼續(xù)關(guān)注~

       

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