TSO 500 ctDNA 2.0版本可提供更快的周轉(zhuǎn)時(shí)間、更高的分析靈敏度和更簡(jiǎn)化的工作流程，進(jìn)一步助力精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展
2023年11月1日，全球基因測(cè)序和芯片技術(shù)領(lǐng)導(dǎo)者因美納公司（納斯達(dá)克股票代碼：ILMN）宣布推出新一代液體活檢基因組分析產(chǎn)品。全新的TruSight? Oncology 500 ctDNA v2（TSO 500 ctDNA v2）是一項(xiàng)科研檢測(cè)產(chǎn)品，可在組織檢測(cè)不可行，或需要補(bǔ)充基于組織的測(cè)試時(shí)，對(duì)血液中的循環(huán)腫瘤 DNA （ctDNA）進(jìn)行無(wú)創(chuàng)全景變異分析（CGP）。
該產(chǎn)品的革新之處包括：從樣品到結(jié)果的周轉(zhuǎn)時(shí)間更快（不到四天），靈敏度更高，對(duì)游離DNA （cfDNA）的起始量要求更低，工作流程也更為精簡(jiǎn)高效，并預(yù)計(jì)將在2024年上半年進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化。
因美納腫瘤部總經(jīng)理Kevin Keegan表示：“業(yè)內(nèi)領(lǐng)先的癌癥中心正越來(lái)越多地采用基于液體活檢的全景變異分析，我們推出TSO 500 ctDNA v2檢測(cè)產(chǎn)品的初衷，是希望支持客戶更便捷地整合分析結(jié)果，進(jìn)而深化對(duì)癌癥研究的洞察。”
重要革新
總周轉(zhuǎn)時(shí)間縮短至四天以內(nèi)。文庫(kù)準(zhǔn)備工作縮短至一天，升級(jí)后的化學(xué)技術(shù)只需單次雜交步驟，總周轉(zhuǎn)時(shí)間可縮短至四天以內(nèi)。大多數(shù)ctDNA CGP檢測(cè)的周轉(zhuǎn)時(shí)間為一周或更久，但為了使生物標(biāo)志物結(jié)果發(fā)揮最大價(jià)值，用戶需要盡早從中獲得洞察，以更好地推進(jìn)精準(zhǔn)腫瘤學(xué)工作。
檢測(cè)分析靈敏度更高，cfDNA起始量更低。該檢測(cè)支持的cfDNA起始量低至5至30納克 （ng）。起始量為20 ng時(shí)，分析靈敏度超過(guò)95%，特異性99.9995%。起始量為10 ng時(shí)，對(duì)于熱點(diǎn)突變的分析靈敏度超過(guò)95%，特異性99.9995%。這一性能的提升得益于化學(xué)技術(shù)的創(chuàng)新和DRAGEN提供的高級(jí)變異分析。
靈活高效的完整解決方案。該檢測(cè)為此前已發(fā)布的樣本至結(jié)果的解決方案提供了更廣泛的途徑，既有手動(dòng)模式，同時(shí)也計(jì)劃于2024年推出自動(dòng)化模式。工作流程的改進(jìn)減少了文庫(kù)制備的實(shí)際操作時(shí)間，自動(dòng)化生物信息學(xué)功能進(jìn)一步精簡(jiǎn)了操作體驗(yàn)。該檢測(cè)還表現(xiàn)出更高的靈活性，可與NovaSeqTM 6000測(cè)序系統(tǒng)兼容（科研模式下的NovaSeqTM 6000Dx，以及預(yù)計(jì)于2024年推出的NovaSeqTM X），同時(shí)提供適應(yīng)各類機(jī)構(gòu)需求的本地和云端生物信息學(xué)解決方案。
有九家機(jī)構(gòu)正在參與因美納的全球早期客戶計(jì)劃，試用TSO 500 ctDNA v2。米蘭大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)教授兼米蘭國(guó)家癌癥研究所病理和實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)部門負(fù)責(zé)人Giancarlo Pruneri表示，他們?cè)趯?shí)驗(yàn)室中對(duì)新版TSO500 ctDNA panel進(jìn)行的初步測(cè)試，“無(wú)疑比之前的版本有所改進(jìn)。”
“值得一提的是，文庫(kù)制備流程的優(yōu)化節(jié)省了一個(gè)工作日，我們能夠更快地進(jìn)行分子分析。”他表示，“同時(shí)檢測(cè)靈敏度更高，支持分析DNA含量較低（20 ng）的樣品，潛在地?cái)U(kuò)大了液體活檢測(cè)試的應(yīng)用范圍。”
隨著液體活檢CGP的實(shí)用性和有效性證據(jù)的不斷累積，如今該技術(shù)已被寫入推薦的腫瘤學(xué)專業(yè)指南。值得關(guān)注的是，對(duì)于非小細(xì)胞肺癌，液體活檢檢測(cè)在組織檢測(cè)結(jié)果無(wú)法獲得或只能延遲獲得時(shí)，展示了其應(yīng)用價(jià)值。這一趨勢(shì)預(yù)計(jì)將延伸至其他惡性實(shí)體瘤，進(jìn)一步驗(yàn)證了我們?cè)诮M織分析之前就對(duì)血液中的cfDNA進(jìn)行廣泛腫瘤分析的這一設(shè)想。
“另一方面，傳統(tǒng)的組織分析常常受限于組織的可用性，通常涉及昂貴的侵入性活檢程序。”Pruneri表示，“在這種情況下，因美納的全新panel應(yīng)運(yùn)而生，旨在解決對(duì)組織可用性的依賴問(wèn)題。”
TSO 500 ctDNA v2配套的自動(dòng)化試劑盒以及檢測(cè)方法預(yù)計(jì)將于2024年上半年推出，將助力實(shí)驗(yàn)室根據(jù)這項(xiàng)技術(shù)不斷增長(zhǎng)的需求進(jìn)行相應(yīng)擴(kuò)展。
關(guān)于TruSight Oncology 500 ctDNA v2
TSO 500 ctDNA v2是一項(xiàng)僅供科研使用的綜合性泛癌種檢測(cè)產(chǎn)品，能夠識(shí)別血漿中523種已知和新出現(xiàn)的腫瘤生物標(biāo)志物。TSO 500 ctDNA v2利用液體活檢樣本中的cfDNA來(lái)識(shí)別對(duì)癌癥發(fā)生和進(jìn)展至關(guān)重要的關(guān)鍵變異，如小 DNA 變異（SV）、拷貝數(shù)變異（CNV）、短和長(zhǎng)插入及缺失 （indel），以及免疫腫瘤學(xué)基因特征，如腫瘤突變負(fù)荷（bTMB）和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（bMSI）。這種液體活檢全景變異分析測(cè)定的內(nèi)容及其設(shè)計(jì)類似于基于組織的TSO 500檢測(cè)，可提供一系列解決方案。強(qiáng)大的DRAGEN生物信息學(xué)支持，可提高TSO 500 ctDNA v2解決方案的性能和靈活性。如需了解有關(guān)TSO 500 ctDNA v2的更多信息，請(qǐng)點(diǎn)擊此處。
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