靶向蛋白降解技術是一種新型的藥物發(fā)現策略,主要通過誘導致病靶蛋白的快速降解發(fā)揮治療作用。它在治療癌癥、傳染性、炎癥和神經退行性疾病等疾病方面顯示出了巨大的潛力,特別是對于那些具有“不可成藥”的致病蛋白靶點的疾病。分子膠降解劑簡化了傳統(tǒng)PROTAC降解劑的結構,具有更好的成藥性,極大豐富了靶向蛋白降解領域的研究。當前,分子膠正以全新的姿態(tài)進入人們的視野。
分子膠介紹
目前,靶向蛋白降解(TPD)技術已成為藥物研發(fā)的一種開創(chuàng)性策略。這種方法正在成為一種新型的治療方法,用于治療癌癥、炎癥和免疫性疾病以及感染等疾病,因為其中許多疾病是由致病蛋白的異常表達驅動的。TPD具有作用范圍更廣、可靶向“不可成藥”靶點以及克服耐藥性等優(yōu)勢而備受矚目。
分子膠是一種接近誘導的小分子,它可以精確地用時間控制各種生物過程,如信號轉導、轉錄、染色質調控和蛋白質折疊、定位和降解(圖1)。分子膠作為接近的化學誘導劑,可以通過形成三元配合物促進兩種蛋白質的二聚或共定位,導致不同的生物學和藥理功能。
圖1.分子膠作用機制
“分子膠”的概念最早出現在1990年代初期,免疫抑制劑環(huán)孢菌素A(CsA) 和FK506是分子膠的第一個例子,研究發(fā)現環(huán)孢菌素A和FK506以分子膠的形式發(fā)揮作用,CsA和FK506可以分別誘導親環(huán)蛋白-CsA-鈣調神經磷酸酶以及 FKBP12-FK506-鈣調神經磷酸酶兩種三元復合物的形成。免疫抑制劑雷帕霉素也可以作為分子膠來穩(wěn)定FKBP12-雷帕霉素-FRB(mTOR)三元復合物。2013年,研究人員闡明了沙利度胺類似物作為分子膠降解劑的作用機制。從2014年后,分子膠降解劑逐漸興起,并逐步發(fā)展成為研發(fā)人員關注的焦點(圖2)。
圖2.分子膠降解劑的研發(fā)歷程
此外,類似分子膠這種化學誘導蛋白復合物的新機制正在成為探索生物過程和開發(fā)治療藥物的有效策略,它激發(fā)了從天然產物和合成分子中發(fā)現分子膠的靈感。目前,分子膠誘導的蛋白質降解已經引起了藥物發(fā)現的廣泛興趣。分子膠降解劑誘導或穩(wěn)定泛素連接酶和目標蛋白(底物)之間的蛋白-蛋白相互作用PPI,導致蛋白質泛素化和隨后的蛋白酶體降解。分子膠通常通過增強已存在的PPI或誘導與E3泛素連接酶的底物受體形成新的PPI復合物來招募靶蛋白進行降解。
與傳統(tǒng)的小分子酶抑制劑或受體拮抗劑相比,分子膠降解劑有幾個優(yōu)點:
1、在作用機制方面,分子膠降解劑以亞化學計量學和催化學的方式驅動目標蛋白的泛素化和降解。
2、分子膠使以前無法獲得或不可成藥的靶蛋白得以降解。經典的小分子抑制劑通過結合到目標蛋白上的一個可配體的口袋來發(fā)揮作用。相比之下,分子膠不需要在目標蛋白上的結合口袋。相反,分子膠誘導或加強受體和目標蛋白之間的相互作用,這些蛋白通常不直接相互作用。
因此,分子膠能夠降解傳統(tǒng)策略難以成藥的治療靶點,并擴大了“可用藥”蛋白的范圍。
分子膠與PROTAC比較
PROTAC和分子膠(molecular glue)是基于泛素蛋白酶體系統(tǒng)的靶向蛋白質降解技術的兩種主要模式(圖3)。其中,PROTAC是通過招募E3泛素連接酶,誘導靶蛋白靠近E3泛素連接酶,導致靶蛋白泛素化和降解。而分子膠是通過修飾泛素連接酶表面,促進或誘導E3泛素連接酶與靶蛋白之間發(fā)生蛋白-蛋白相互作用(PPI),使靶蛋白泛素化進而降解。
此外,PROTACs的靶蛋白和分子機制是可以預測的,可以根據配體與靶蛋白的結合方式進行合理設計。而分子膠的發(fā)現則具有很大的偶然性,缺乏系統(tǒng)的發(fā)現手段和合理的設計策略。分子膠無法像PROTAC一樣可以通過各組分大規(guī)模篩選獲得,所以迄今為止發(fā)現的分子膠降解劑寥寥可數。目前,分子膠藥物的發(fā)現策略主要包括:1、高通量篩選2、從天然產物中發(fā)現 3、化學基因組篩選。
分子膠的優(yōu)勢在于可以通過促進泛素連接酶和靶蛋白之間的PPI,降解無配體結合的蛋白,表現出優(yōu)于小分子藥物的治療效果。然而,PROTAC通常具有高分子量(MW)、較差的細胞滲透性和藥代動力學PK特征,這阻礙了PROTACs在臨床治療中的發(fā)展。分子膠則具有較低的分子量、較高的細胞通透性和更好的口服吸收,符合“成藥五規(guī)則”,表現出更好的成藥性。因此,分子膠藥物表現出極大的臨床潛力。
圖3.分子膠與PROTAC對比
分子膠降解劑最新研究進展
目前,全球共有3款分子膠藥物獲批上市。分別是沙利度胺及其衍生物(來那度胺和泊馬度胺)。這三款藥物因具有免疫調節(jié)、抗炎和抗腫瘤作用而被美國FDA批準上市,用于治療多發(fā)性骨髓瘤等疾病。此外,也有多款分子膠藥物獲批臨床。國內外藥企均在分子膠領域進行布局,包括:諾華、拜耳、BMS等制藥巨頭。這展示了分子膠藥物未來巨大的市場前景。
圖4.上市或正在臨床階段的分子膠
小結
近年來,靶向蛋白降解(TPD)是一個富有前景的研究領域,它的出現改變了藥物開發(fā)的格局,開拓了新的藥物靶點和藥物藍圖,為不可成藥靶標的藥物研發(fā)開辟了新的途徑。盡管作為靶向蛋白降解劑之一的分子膠藥物的研發(fā)還處于起步階段,且分子膠藥物的發(fā)現具有很大的偶然性,尚無合理設計分子膠降解劑的策略。但隨著藥物研發(fā)技術的不斷突破與革新,我們相信會有更多的分子膠藥物獲批臨床,推進上市,造福更多的患者。
參考文獻
1、Molecular Glues for Targeted Protein Degradation: From Serendipity to Rational Discovery. https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c00895
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3、The Rise of Molecular Glues. Cell 2021, 184, 3?9.
4、A critical evaluation of the approaches to targeted protein degradation for drug discovery. Drug Discovery Today: Technol. 2019, 31, 5?13.
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