自從新冠病毒引起新型冠狀病毒肺炎COVID-19爆發(fā)以來,該疾病在全球范圍內(nèi)迅速蔓延??紤]到COVID-19大流行的潛在威脅,全球的科學(xué)家一直在努力了解這種新病毒以及病理生理學(xué),以發(fā)現(xiàn)可能的治療方案,并發(fā)現(xiàn)有效的治療藥物和**。為了支持目前的研究和發(fā)展,美國化學(xué)會(AmericanChemistrySociety,ACS)于2020年3月12日于《ACSCentralScience》發(fā)布了一份特別報告[1],深度盤點(diǎn)了已發(fā)表的關(guān)于該病毒潛在治療藥物和**的科學(xué)信息,并分析了針對病毒基因表達(dá)的**、治療性抗體、核酸療法和細(xì)胞因子等四種療法的專利。本報告提供的信息為正在開發(fā)的治療方法和**提供了堅實的知識基礎(chǔ)。
冠狀病毒是一種相對較大的病毒,它含有一條單鏈陽性RNA基因組,被包裹在一個膜包膜內(nèi)。這種病毒的膜上布滿了糖蛋白尖刺,使得冠狀病毒
一、冠狀病毒關(guān)鍵蛋白及其在病毒感染中的功能
識別靶點(diǎn)對于識別具有高靶點(diǎn)特異性的藥物和/或發(fā)現(xiàn)可用于治療新冠病毒感染的現(xiàn)有藥物具有重要意義。表1列出了可能的靶點(diǎn)、它們在病毒感染中的作用,以及據(jù)報道作用于類似病毒中相應(yīng)靶標(biāo)的代表性現(xiàn)有藥物或候選藥物,以便評估它們對新冠病毒感染的影響。
表1 治療COVID-19的侯選靶點(diǎn)和部分潛在藥物
3CLpro和PLpro是兩種病毒蛋白酶,負(fù)責(zé)將病毒肽裂解成功能單位,在病毒復(fù)制和包裝過程中發(fā)揮重要作用。靶向這些蛋白酶的藥物有地瑞那韋(darunavir)。
RdRp是負(fù)責(zé)病毒RNA合成的RNA聚合酶,可能被現(xiàn)有的抗病毒 藥物或候選藥物(如瑞德西韋)阻斷。
病毒S蛋白與其受體ACE2在宿主細(xì)胞上的相互作用,以及隨后進(jìn)入細(xì)胞的病毒內(nèi)吞作用,也可能是一個可行的藥物靶點(diǎn)。例如,廣譜抗病毒 藥物阿比多爾,作為宿主細(xì)胞融合抑制劑防止流感病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞,目前已進(jìn)入治療新冠病毒的臨床試驗階段。
宿主細(xì)胞產(chǎn)生的蛋白酶TMPRSS2在S蛋白的蛋白水解過程中起著重要作用,它能夠促進(jìn)S蛋白與ACE2受體結(jié)合。已經(jīng)證明,臨床批準(zhǔn)的藥物TMPRSS2抑制劑甲磺酸卡莫司他能夠阻止新冠病毒進(jìn)入人體細(xì)胞,這表明它有可能成為COVID-19的藥物。
另外,ACE2還在調(diào)節(jié)血壓以及體內(nèi)液體和電解質(zhì)平衡過程中發(fā)揮重要作用。ACE2催化血管緊張素II降解為血管緊張素,二者之間的平衡至關(guān)重要,因為血管緊張素II與血管緊張素AT1受體結(jié)合導(dǎo)致血管收縮,而血管緊張素則通過AT2介導(dǎo)血管舒張。因此,一些針對這些蛋白的藥物或化合物(如L-163491:AT1受體的部分拮抗劑和AT2受體的部分激動劑)是否可以減輕新冠病毒引起的肺損傷還有待確定。
二、與關(guān)鍵蛋白靶點(diǎn)相關(guān)的專利和潛在候選藥物
CAS數(shù)據(jù)庫收錄了與冠狀病毒關(guān)鍵蛋白相關(guān)的專利。表2列出了這些專利中使用CAS注冊號(CAS RN)報告的蛋白靶標(biāo)和相關(guān)治療化合物的專利數(shù)量。其中,3CLpro和RdRp靶點(diǎn)受到了更多研發(fā)人員的關(guān)注,并發(fā)現(xiàn)了更多具有治療潛力的化合物。
三、對COVID-19有潛在治療效果的現(xiàn)有藥物
由于新冠病毒是一種新發(fā)現(xiàn)的病原體,目前還沒有確定或可用的特定藥物。因此,經(jīng)濟(jì)有效的治療策略是重新利用現(xiàn)有藥物?;诓《镜幕蚪M序列信息和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)建模,科學(xué)界已經(jīng)能夠迅速找出對COVID-19有潛在治療效果的現(xiàn)有藥物。表3總結(jié)了這些藥物及其可能的作用機(jī)制。
四、冠狀病毒相關(guān)疾病的生物制劑
新冠病毒正在世界各地造成嚴(yán)重和持續(xù)的流行病學(xué)問題。生物制劑能夠拓寬COVID-19的治療方案,并且利用已有知識和應(yīng)對SARS和MERS的科研經(jīng)驗,為開發(fā)新冠病毒特異性治療藥物提供了一種策略。通過分析CAS數(shù)據(jù)庫中生物制品相關(guān)的專利,科研人員篩選到了超過500項使用生物制劑來治療和預(yù)防SARS和MERS的專利。其中,**開發(fā)是最大的一類(363項),其次是治療性抗體(99項)、干擾RNA(35項)和細(xì)胞因子(22項)。
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目前,必須開發(fā)安全有效的**以控制COVID-19大流行,消除其傳播,并最終預(yù)防其未來的復(fù)發(fā)。由于新冠病毒與另外兩種致命性冠狀病毒SARS和MERS具有顯著的序列同源性,在這些涉及與SARS和MERS病毒相關(guān)**的專利可能有助于設(shè)計抗新冠病毒**。
抗病毒**通常分為以下幾種類型:非活性或減毒活**、類病毒顆粒(VLP)、病毒載體、蛋白基、基于DNA和mRNA的**。在CAS數(shù)據(jù)庫中,有363項專利與預(yù)防病毒疾?。ò⊿ARS和MERS)的**開發(fā)相關(guān)。其中,175項專利公開了可能與SARS和MERS有關(guān)的非冠狀病毒**,而188項專利與具有明顯免疫應(yīng)答的SARS和MERS**直接相關(guān)。15項專利公開了滅活減毒**信息,28項專利描述了DNA**,21項專利公開了病毒載體**信息,13項專利公開了VLP**信息,3項專利集中在mRNA**上(見圖2)。
據(jù)報道,相比減毒活**、全長S蛋白**和基于DNA的S蛋白**,病毒S蛋白亞單位**會產(chǎn)生更高的中和抗體效價和更完整的保護(hù)。這些專利中,大約一半的專利集中在蛋白質(zhì)**上,包括蛋白質(zhì)亞單位**和專門針對病毒S蛋白S1亞單位的受體結(jié)合域(RBD)的**??偟膩碚f,S蛋白/基因是SARS/MERS**開發(fā)的首選靶點(diǎn),同樣的策略在開發(fā)新冠病毒**方面也可能有用。
抗體
99項治療性抗體專利中包含了對SARS和MERS有治療和/或診斷潛力的抗體信息。其中,23項專利申請了SARS特異性抗體的制備,17項專利為MERS特異性抗體,21項為具有診斷應(yīng)用的抗體專利。與SARS病毒類似,新冠病毒S蛋白中的受體結(jié)合域(RBD)與人類ACE2受體結(jié)合,從而進(jìn)入宿主細(xì)胞。在病毒感染中,SARS病毒中的S蛋白,而不是其他M、E和N結(jié)構(gòu)蛋白引起免疫應(yīng)答。對SARS治療性抗體相關(guān)專利中的靶點(diǎn)進(jìn)行分析,分析結(jié)果顯示超過90%的抗體直接針對S蛋白,包括其RBD。這些數(shù)據(jù)表明,S蛋白可能是新冠病毒抗體的潛在靶點(diǎn)。
另外38項專利是對SARS和MERS治療有用的其他類型抗病毒抗體的專利,其中包括靶向IL-6/IL-6R、TLR3、CD16、ITAM、DC-SIGN、ICAM-3和IP-10/CXCL10蛋白的抗體。據(jù)報道,細(xì)胞因子風(fēng)暴與新冠病毒感染患者的疾病嚴(yán)重程度相關(guān)。收入ICU的患者促炎細(xì)胞因子和趨化因子的濃度更高(尤其是G-CSF、 IP-10/CXCL10、MCP1和TNFα),以及來自Th2細(xì)胞的細(xì)胞因子(如IL-4和IL-10)升高。
細(xì)胞因子
細(xì)胞因子是一種低分子量的蛋白質(zhì),在免疫系統(tǒng)對病原體入侵的反應(yīng)中起化學(xué)信號的作用。對入侵的病原體(如病毒)作出反應(yīng)而產(chǎn)生的各種細(xì)胞因子有助于宿主機(jī)體消滅病原體的能力。特定類型的細(xì)胞因子,包括趨化因子、干擾素(IFNs)、白細(xì)胞介素和淋巴因子,在過去40年的文獻(xiàn)中都有報道和描述。截至2020年初,CAS數(shù)據(jù)庫收錄了76724份文獻(xiàn)中與細(xì)胞因子相關(guān)的特定類型的700多個詞條,其中包括11837項專利。
在病毒感染過程中,機(jī)體產(chǎn)生的最顯著的細(xì)胞因子是干擾素,它會干擾病毒的復(fù)制。干擾素被分類為I型(包括IFN-α、IFN-β、IFN-δ、IFN-ε、IFN-κ、IFN-ν、IFN-τ和IFN-ω),II型(IFN-γ)和III型(IFN-λ)。由于干擾素和干擾素融合蛋白具有干擾病毒復(fù)制的能力,它們在過去20年中一直被用作治療病毒感染的藥物。研究人員發(fā)現(xiàn),有不少的專利使用干擾素來治療SARS感染。
RNA治療
RNA干擾(RNA interference, RNAi)是小的互補(bǔ)RNA雙鏈以特定的mRNA分子為靶點(diǎn),對其進(jìn)行中和,從而抑制基因表達(dá)或基因翻譯。自20世紀(jì)90年代末發(fā)現(xiàn)RNAi以來,它已成為一種沉默或抑制與病**和發(fā)病機(jī)制相關(guān)靶基因的常用方法。CAS數(shù)據(jù)庫中有35項專利披露了RNAi在SARS治療中的應(yīng)用,其中28項專利使用了siRNA分子,3項專利使用了反義寡核苷酸,2項專利使用了RNA適配體,1項專利使用了核糖酶,1項專利使用了microRNA抑制劑。
五、結(jié)語
COVID-19疫情的爆發(fā)表明,RNA病毒通過受突變和基因重組以及跨物種傳播,從而引起新型傳染病,能夠?qū)θ蛉嗣竦慕】禈?gòu)成嚴(yán)重威脅。盡管以前曾發(fā)生過SARS和MERS呼吸系統(tǒng)疾病的冠狀病毒感染大爆發(fā),但世界仍然沒有做好有效控制當(dāng)前COVID-19疫情的有效手段,這一點(diǎn)可以從COVID-19在全世界導(dǎo)致數(shù)千人死亡得到證明。
為了減少對人類生活和全球衛(wèi)生保健系統(tǒng)的巨大影響,有必要共同努力開發(fā)有效的藥物和**,以應(yīng)對現(xiàn)有和潛在的未來冠狀病毒感染和其他高致病性病毒暴發(fā)。鑒于臨床藥物開發(fā)的成本高昂且過程艱難,COVID-19的爆發(fā)進(jìn)一步突出了開發(fā)相對廣譜抗病毒 藥物的價值以及應(yīng)用人工智能等創(chuàng)新方法以促進(jìn)藥物發(fā)現(xiàn)的重要性。鑒于新藥開發(fā)的漫長過程,現(xiàn)有藥物再利用策略已成為直接治療新冠病毒感染者的首選方案之一。本報告中篩選的潛在候選藥物,可作為藥物開發(fā)的信息起點(diǎn)。**對預(yù)防未來與冠狀病毒有關(guān)的流行病至關(guān)重要,令人欣慰的是4種MERS冠狀病毒DNA候選**于2019年9月開始I期臨床試驗, Moderna 公司于2020年2月發(fā)布第一批針對新冠病毒的mRNA**mRNA-1273將準(zhǔn)備在美國進(jìn)行1期研究。
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