利用微生物將生物質原料轉化為燃料、材料和化學品是生物制造領域的研究熱點,其關鍵挑戰(zhàn)是如何實現(xiàn)生物質中葡萄糖等六碳糖和木糖等五碳糖的同等高效利用。
已經(jīng)有很多研究嘗試對單一菌株的代謝途徑進行改造,或采用不同的菌株進行分工合作,以實現(xiàn)五、六碳糖的同步利用。但受限于五碳糖不能被高效利用,目標化學品的生產(chǎn)效率普遍不高。
近年來,隨著合成生物學的快速發(fā)展和微生物組計劃的提出,合成微生物組也在加速發(fā)展。為了實現(xiàn)生物質原料中五、六碳糖組分的同等高效利用,中國科學院微生物研究所李寅課題組提出了創(chuàng)制“Y型人工菌群”的新概念(如圖)。Y型人工菌群由兩株源于同一出發(fā)菌株、能夠生產(chǎn)同樣目標產(chǎn)物的工程菌株構成。Y型的兩個“頭部”代表五、六碳糖的代謝途徑,一個“身體”代表共同的目標產(chǎn)物生產(chǎn)途徑。
Y型人工菌群應當具備四個特點:(1)能同等高效代謝五、六碳糖;(2)五、六碳糖的代謝正交,互不干擾;(3)五、六碳糖的代謝速率與目標產(chǎn)物生產(chǎn)速率匹配;(4)菌群組成菌株均為全染色體編輯,無需抗生素和誘導劑,以保持生產(chǎn)過程中的遺傳穩(wěn)定性。
為測試這一概念可行性,研究人員以丁醇為目標產(chǎn)物,通過對大腸桿菌進行系統(tǒng)的代謝工程改造,創(chuàng)制了一個Y型人工菌群。其中一株菌為能夠優(yōu)先利用六碳糖高產(chǎn)丁醇的大腸桿菌EB243,另外一株菌為能夠高效利用五碳糖高產(chǎn)丁醇的大腸桿菌EB243X。該菌群以混合糖為原料進行批式發(fā)酵,可生產(chǎn)約21 g/L丁醇,得率為理論值的85%,是目前報道利用混合糖生產(chǎn)丁醇的水平。
進一步對該Y型人工菌群進行分析發(fā)現(xiàn),可通過調整兩個菌株的初始比例,使該菌群適應不同比例的五、六碳糖底物以及不同的通氣條件,故Y型人工菌群表現(xiàn)出較強的適應性和結構穩(wěn)定性,具有工業(yè)應用的潛力。
這項研究是該課題組繼2017年創(chuàng)建全染色體編輯的高產(chǎn)丁醇菌株(Metabolic Engineering, 2017, 44: 284-292)后又一具有工業(yè)化潛力的研究,為利用合成微生物組思想解決五、六碳糖共利用問題提供了新思路,也為進一步降低生物法生產(chǎn)丁醇的成本奠定了基礎。
相關工作已發(fā)表在領域期刊Metabolic Engineering上,博士生趙春華和盧旺達籍博士生Jean Paul Sinumvayo為該文的共同第一作者,研究員李寅和張延平為共同通訊作者。該項研究得到國家自然科學基金和“863”計劃資助。
合作咨詢
肖女士 021-33392297 Kelly.Xiao@imsinoexpo.com