CRISPR發(fā)現(xiàn)了癌癥的重大變化，基因融合或許成為重要藥物靶點(diǎn)

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來源：生物探索

2019-05-21

CRISPR揭示一種新的基因融合體，不僅能為多種癌癥提供新的藥物靶點(diǎn)，還有助于構(gòu)建癌癥依賴性地圖，為未來癌癥精確治療提供新的研究動(dòng)力。

基因融合（Fusion gene），由兩個(gè)不同的基因異常結(jié)合而引起的，在癌癥的發(fā)生過程中起著重要的作用。通常，它們被用作為預(yù)測(cè)特定癌癥患者藥物反應(yīng)以及預(yù)后的診斷工具，以評(píng)估患者的治療結(jié)果。它們也是一些最新癌癥治療的重要藥物靶點(diǎn)。

到目前為止，研究人員已經(jīng)確定了大約20,000個(gè)基因融合，但是它們?cè)诎l(fā)展癌癥中的確切功能和作用我們?nèi)匀恢跎?。因此，區(qū)分基因融合是否對(duì)癌癥存活有影響，具有重要的臨床意義。

近日，《Nature Communications》雜志上刊載了一篇關(guān)于基因融合的最新研究。研究人員利用CRISPR基因編輯技術(shù), 揭示了能夠?qū)Π┘?xì)胞生長(zhǎng)起到至關(guān)重要作用的基因融合類型，并且發(fā)現(xiàn)了一種新的基因融合，可以為包括腦癌和卵巢癌在內(nèi)的多種癌癥提供新的藥物靶點(diǎn)。

首次基因融合的大規(guī)模研究

作為對(duì)基因融合功能的首次大規(guī)模研究， Wellcome Sanger研究所聯(lián)合EMBL-EBI研究所、 Open Targets平臺(tái)、GSK公司及其合作者共同分析了來自43種不同癌癥類型（包括兒科癌癥和臨床需求未得到滿足的癌癥）的1,000多種人類癌細(xì)胞系中的8000多種基因融合。

之后，他們利用350多種抗癌藥物來對(duì)這些細(xì)胞系進(jìn)行測(cè)試，以確定現(xiàn)有的可以用于治療潛在基因融合相關(guān)癌癥的藥物，并利用CRISPR工具來尋找哪些關(guān)鍵基因融合對(duì)癌細(xì)胞的存活至關(guān)重要。

研究小組發(fā)現(xiàn)，90％的基因融合在癌癥中并不起重要作用，但當(dāng)從病人腫瘤的基因組序列推斷癌癥的原因時(shí)，這些結(jié)果應(yīng)該被考慮。第一作者、Wellcome Sanger研究所的Gabriele Picco博士說：“隨著對(duì)患者的腫瘤進(jìn)行基因組測(cè)序變得更普遍，那些對(duì)于數(shù)據(jù)進(jìn)行解讀的人必須要更加小心，需要考慮是否存在特定基因融合驅(qū)動(dòng)了癌癥的發(fā)展。

Wellcome Sanger研究所和Open Targets平臺(tái)的Mathew Garnett博士表示：“我們還發(fā)現(xiàn)了對(duì)癌癥存活發(fā)揮關(guān)鍵作用的一些基因融合。這些基因變化可能為現(xiàn)有藥物治療患者帶來新的機(jī)會(huì)，也可能會(huì)成為未來新的藥物靶點(diǎn)。目前，我們發(fā)現(xiàn)了一種新的基因融合——YAP1-MAML2，它為包括卵巢癌在內(nèi)的幾種癌癥提供了一種新的藥物靶點(diǎn)。”

研究結(jié)果還表明，包括RAF1、ROS1和BRD4的基因融合體均可能是現(xiàn)有藥物的靶向。這意味著，患有罕見亞型胰腺癌，乳腺癌和肺癌的患者將擁有新的治療

海德堡大學(xué)的Julio Saez-Rodriguez博士對(duì)此結(jié)果十分感興趣。他說，這項(xiàng)研究有助于進(jìn)一步利用基因融合體作為治療性生物標(biāo)記，并將患者分類進(jìn)行臨床試驗(yàn)，促進(jìn)更有針對(duì)性和更高效的臨床研究方法。

今后，Sanger，EMBL-EBI和Open Targets以及 GSK的研究人員將合作促進(jìn)這些研究成果轉(zhuǎn)化，為新的治療方法帶來契機(jī)。這一研究有助力于建立癌癥依賴性地圖，以及形成未來癌癥精確治療方案。

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