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基因數(shù)據(jù)揭秘, 改變飲食習(xí)慣后北極熊越變越白

來源:生物探索
  2019-06-20
基因組數(shù)據(jù)顯示,改變飲食習(xí)慣真的會越來越白,起碼在熊身上是應(yīng)驗(yàn)的。

       早在40萬年前,北極熊跟棕熊還是一家親的時,北極熊還沒有那么白。后來由于某種原因(可能是北極熊覺得伙食條件太差),兩個家族分道揚(yáng)鑣。

       北極熊的族長帶領(lǐng)族熊遷徙到北極。在苦寒之地缺衣少食,但是北極熊勵志要成為“北大荒”食物鏈頂端的那頭熊,于是放棄了“素食者”的身份轉(zhuǎn)變成“肉食者”。

       可能是“營養(yǎng)條件”跟上了,北極熊變得越來越富態(tài)白皙,還得到了“豪華皮膚”,進(jìn)化出一身雪白的熊皮大氅。

       近日,《美國國家科學(xué)院學(xué)報》上發(fā)表的一篇論文為以上小編一本正經(jīng)的胡說八道提供了有力證明。這是第一個研究北極熊和棕熊全基因組拷貝數(shù)變異(CNV),指個體之間基因組特定部分拷貝數(shù)的差異)的群體研究。

       美國科學(xué)家們從基因組層面對北極熊生態(tài)適應(yīng)進(jìn)行了新的探究。他們明確指出:北極熊的基因拷貝數(shù)在飲食結(jié)構(gòu)從植物轉(zhuǎn)向肉類時發(fā)生了快速變化。

       飲食對北極熊CNV的影響

       棕熊是雜食動物,主要以漿果、草、香草、樹根和球莖等植物為食,自從與棕熊各自為政后,北極熊迅速進(jìn)化成食肉動物,以海豹和其他動物為食。

       研究人員利用現(xiàn)有的原始全基因組DNA序列數(shù)據(jù),比較了17只北極熊、9只棕熊和2只黑熊基因拷貝數(shù)的差異。

       研究結(jié)果表明,這種差異在北極熊適應(yīng)北極的過程中發(fā)揮了重要作用。

       美國馬薩諸塞大學(xué)食品研究助理John G. Gibbons表示,他和他的同事觀察到與熊飲食有關(guān)的基因拷貝數(shù)的差異。這項(xiàng)研究解決了一個大的進(jìn)化問題,即飲食如何塑造基因組。

       兩個意外的發(fā)現(xiàn)

       研究人員在比對全基因組DNA序列數(shù)據(jù)時還意外收獲了兩個奇妙的發(fā)現(xiàn)。在被標(biāo)注為嗅覺受體的基因中,88%的基因在北極熊身上的拷貝數(shù)比棕熊和黑熊要低。Gibbons解釋道:“首先北極地區(qū)的氣味比較少。其次,北極熊主要專注于兩件事——海豹和配偶。它們不像棕熊那樣在叢林中尋找食物。”

       另一個發(fā)現(xiàn)是,北極熊比棕熊擁有更少的AMY1B基因副本。AMY1B編碼唾液淀粉酶,這種酶在動物咀嚼植物性食物時啟動淀粉的消化。

       Gibbons說:“吃高淀粉食物的人群比吃低淀粉食物的人群有更多的這種基因拷貝。我們在熊身上也發(fā)現(xiàn)了同樣的情況。如果你想想它們的飲食,這是有道理的。”

       CNV將是研究自然選擇的新工具

       以前傳統(tǒng)的研究方法,CNV很難被檢測到,所以它們總是被忽視。近15年來,隨著DNA測序技術(shù)的發(fā)展,從基因組數(shù)據(jù)中檢測和量化CNVs的計算方法也得到了發(fā)展。此次對北極熊的研究數(shù)據(jù)正好填補(bǔ)這個空白。

       這項(xiàng)研究充分顯示了分析CNV在研究自然選擇驅(qū)動進(jìn)化變化時的重要作用。

       Gibbons說:“進(jìn)化作用于不同類型的基因變異,以達(dá)到同樣的目的?,F(xiàn)在我們已經(jīng)有了檢測CNVs的技術(shù),大家一致認(rèn)為,這種類型的突變應(yīng)該與傳統(tǒng)的檢測自然選擇形成的基因組部分的方法一起進(jìn)行檢測。”

       研究人員計劃在北極熊基因組研究的基礎(chǔ)上,對另一個物種(智人)進(jìn)行研究。

       下一步研究者打算觀察兩個不同的人類群體,看看我們是否在拷貝數(shù)變異上看到相似的差異。

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